MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 96621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003910	TTGG	2	8	68	75	0 %	50 %	50 %	0 %	71278268
2	NC_003910	AAG	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278268
3	NC_003910	CTT	2	6	255	260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71278268
4	NC_003910	ATT	2	6	284	289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278268
5	NC_003910	GTA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278268
6	NC_003910	ATT	2	6	377	382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278268
7	NC_003910	GCT	3	9	507	515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278268
8	NC_003910	ATT	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278268
9	NC_003910	TGG	2	6	566	571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71278268
10	NC_003910	TTA	2	6	594	599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278268
11	NC_003910	CAA	2	6	626	631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278268
12	NC_003910	AAT	2	6	699	704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278268
13	NC_003910	ACT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278268
14	NC_003910	GAT	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278268
15	NC_003910	T	6	6	768	773	0 %	100 %	0 %	0 %	71278268
16	NC_003910	AAG	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278268
17	NC_003910	GAT	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278268
18	NC_003910	TTGG	2	8	910	917	0 %	50 %	50 %	0 %	71278268
19	NC_003910	TGA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278268
20	NC_003910	T	6	6	1020	1025	0 %	100 %	0 %	0 %	71278268
21	NC_003910	ATA	2	6	1183	1188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278268
22	NC_003910	AACG	2	8	1192	1199	50 %	0 %	25 %	25 %	71278268
23	NC_003910	TAAAAT	2	12	1214	1225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278268
24	NC_003910	AACC	2	8	1304	1311	50 %	0 %	0 %	50 %	71278268
25	NC_003910	TGG	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71278268
26	NC_003910	ACA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278268
27	NC_003910	TGCC	2	8	1370	1377	0 %	25 %	25 %	50 %	71278268
28	NC_003910	AGA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278268
29	NC_003910	TAA	2	6	1455	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278268
30	NC_003910	ATT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279230
31	NC_003910	ATT	3	9	1534	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279230
32	NC_003910	GTCA	2	8	1611	1618	25 %	25 %	25 %	25 %	71279230
33	NC_003910	ATT	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279230
34	NC_003910	AG	3	6	1744	1749	50 %	0 %	50 %	0 %	71279230
35	NC_003910	GTA	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279230
36	NC_003910	CTG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71279230
37	NC_003910	GAA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71279230
38	NC_003910	CCAA	2	8	1935	1942	50 %	0 %	0 %	50 %	71279230
39	NC_003910	TTA	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279230
40	NC_003910	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71279230
41	NC_003910	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279230
42	NC_003910	ATT	2	6	2171	2176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279230
43	NC_003910	AGA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71279230
44	NC_003910	GAA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71279230
45	NC_003910	AGT	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279230
46	NC_003910	TGT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71279230
47	NC_003910	TAC	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71280559
48	NC_003910	ATC	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71280559
49	NC_003910	T	7	7	2712	2718	0 %	100 %	0 %	0 %	71280559
50	NC_003910	AAT	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280559
51	NC_003910	AGT	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280559
52	NC_003910	T	8	8	2762	2769	0 %	100 %	0 %	0 %	71280559
53	NC_003910	CTTG	2	8	2812	2819	0 %	50 %	25 %	25 %	71280559
54	NC_003910	TGT	2	6	2838	2843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280559
55	NC_003910	A	6	6	2955	2960	100 %	0 %	0 %	0 %	71280559
56	NC_003910	T	6	6	3001	3006	0 %	100 %	0 %	0 %	71280559
57	NC_003910	GGA	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71280559
58	NC_003910	ATT	2	6	3152	3157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280559
59	NC_003910	AT	3	6	3210	3215	50 %	50 %	0 %	0 %	71280559
60	NC_003910	A	7	7	3311	3317	100 %	0 %	0 %	0 %	71280559
61	NC_003910	GA	4	8	3349	3356	50 %	0 %	50 %	0 %	71280559
62	NC_003910	AG	3	6	3429	3434	50 %	0 %	50 %	0 %	71280559
63	NC_003910	ACA	2	6	3450	3455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71280559
64	NC_003910	GTT	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280559
65	NC_003910	AATT	2	8	3494	3501	50 %	50 %	0 %	0 %	71280559
66	NC_003910	TGA	2	6	3537	3542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280559
67	NC_003910	TTA	2	6	3614	3619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280559
68	NC_003910	AGA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71280559
69	NC_003910	TGA	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280559
70	NC_003910	AG	3	6	3681	3686	50 %	0 %	50 %	0 %	71280559
71	NC_003910	TGG	2	6	3726	3731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71280559
72	NC_003910	AAT	2	6	3745	3750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280559
73	NC_003910	GTAT	2	8	3854	3861	25 %	50 %	25 %	0 %	71281227
74	NC_003910	GAT	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
75	NC_003910	CAT	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281227
76	NC_003910	TCAGTG	2	12	3985	3996	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71281227
77	NC_003910	GAT	2	6	4000	4005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
78	NC_003910	CTG	3	9	4049	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
79	NC_003910	TTA	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281227
80	NC_003910	GGT	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281227
81	NC_003910	TGG	2	6	4095	4100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281227
82	NC_003910	AGT	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
83	NC_003910	CGC	2	6	4192	4197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71281227
84	NC_003910	TGA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
85	NC_003910	GAA	2	6	4414	4419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
86	NC_003910	AGA	2	6	4425	4430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
87	NC_003910	TGG	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281227
88	NC_003910	ATT	2	6	4469	4474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281227
89	NC_003910	GAA	2	6	4501	4506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
90	NC_003910	GCAAT	2	10	4555	4564	40 %	20 %	20 %	20 %	71281227
91	NC_003910	ATG	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
92	NC_003910	TAA	2	6	4602	4607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281227
93	NC_003910	TGG	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281227
94	NC_003910	AAG	2	6	4688	4693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
95	NC_003910	GAA	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
96	NC_003910	TGA	2	6	4743	4748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
97	NC_003910	CTG	2	6	4766	4771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
98	NC_003910	CAAA	2	8	4810	4817	75 %	0 %	0 %	25 %	71281227
99	NC_003910	ATC	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281227
100	NC_003910	TTG	2	6	4931	4936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281227
101	NC_003910	TGC	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
102	NC_003910	GCT	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
103	NC_003910	AT	4	8	5065	5072	50 %	50 %	0 %	0 %	71281227
104	NC_003910	CTG	2	6	5087	5092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
105	NC_003910	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
106	NC_003910	TCT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281227
107	NC_003910	TGA	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
108	NC_003910	CAT	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281227
109	NC_003910	CCGATG	2	12	5297	5308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	71281227
110	NC_003910	TTA	2	6	5332	5337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281227
111	NC_003910	TCT	2	6	5345	5350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281227
112	NC_003910	CCA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281227
113	NC_003910	AAAG	2	8	5418	5425	75 %	0 %	25 %	0 %	71281227
114	NC_003910	GAT	3	9	5449	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
115	NC_003910	AAC	2	6	5475	5480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281227
116	NC_003910	TGAA	2	8	5510	5517	50 %	25 %	25 %	0 %	71281227
117	NC_003910	TGC	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
118	NC_003910	TGA	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
119	NC_003910	TGA	2	6	5670	5675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
120	NC_003910	TGAAG	2	10	5754	5763	40 %	20 %	40 %	0 %	71281227
121	NC_003910	ATTT	2	8	5782	5789	25 %	75 %	0 %	0 %	71281227
122	NC_003910	TCAA	2	8	5893	5900	50 %	25 %	0 %	25 %	71281227
123	NC_003910	GAA	2	6	5911	5916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
124	NC_003910	GTG	2	6	5933	5938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281227
125	NC_003910	CAG	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281227
126	NC_003910	AT	3	6	6009	6014	50 %	50 %	0 %	0 %	71281227
127	NC_003910	AGC	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281227
128	NC_003910	ACT	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281227
129	NC_003910	AT	3	6	6215	6220	50 %	50 %	0 %	0 %	71281227
130	NC_003910	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281893
131	NC_003910	T	6	6	6528	6533	0 %	100 %	0 %	0 %	71281893
132	NC_003910	CGT	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281893
133	NC_003910	ATT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281893
134	NC_003910	AGA	2	6	6747	6752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281893
135	NC_003910	CAA	2	6	6841	6846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281893
136	NC_003910	TA	3	6	6913	6918	50 %	50 %	0 %	0 %	71281893
137	NC_003910	TTA	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281893
138	NC_003910	ATT	2	6	7050	7055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281893
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141	NC_003910	GTAC	2	8	7216	7223	25 %	25 %	25 %	25 %	71281893
142	NC_003910	TTA	2	6	7248	7253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281893
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145	NC_003910	ACT	2	6	7326	7331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281166
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159	NC_003910	TTG	2	6	7996	8001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281166
160	NC_003910	TGA	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281166
161	NC_003910	TGA	2	6	8114	8119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281166
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172	NC_003910	ATT	2	6	8846	8851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281166
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253	NC_003910	AAG	2	6	13450	13455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71279252
254	NC_003910	AGCAA	2	10	13569	13578	60 %	0 %	20 %	20 %	71279252
255	NC_003910	ATA	3	9	13622	13630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71279252
256	NC_003910	CTT	2	6	13700	13705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71279252
257	NC_003910	GGT	2	6	13733	13738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71279252
258	NC_003910	ACA	2	6	14077	14082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71277913
259	NC_003910	AAG	2	6	14195	14200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71280096
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262	NC_003910	T	6	6	14392	14397	0 %	100 %	0 %	0 %	71280096
263	NC_003910	AGCG	2	8	14418	14425	25 %	0 %	50 %	25 %	71280096
264	NC_003910	ATT	2	6	14436	14441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280096
265	NC_003910	A	6	6	14452	14457	100 %	0 %	0 %	0 %	71280096
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268	NC_003910	TAAA	2	8	14738	14745	75 %	25 %	0 %	0 %	71280096
269	NC_003910	ATCA	2	8	14798	14805	50 %	25 %	0 %	25 %	71280096
270	NC_003910	AATT	2	8	14891	14898	50 %	50 %	0 %	0 %	71280096
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